鸡传染性支气管炎病毒W株膜蛋白基因的分子特征
[目的] 研究鸡传染性支气管炎病毒(IBV)W株膜蛋白基因的分子特征.[方法] 根据GenBank中已发表的鸡传染性支气管炎病毒M基因序列,设计并合成1对特异性引物,利用RT-PCR技术成功扩增了IBV河南地方分离毒株W株M基因全长片段,然后进行克隆、测序,并与GenBank中发表的11株国内外参考毒株进行比较分析.[结果] 获得的W株M基因全长为681 bp,编码M蛋白226个氨基酸残基,其N端的前60 nt为前导序列,近N端含有2个潜在的N-糖基化位点;3个跨膜区域分别位于21～37,45～68,74～94 aa处,在171～176,183～193 aa处有2个潜在的抗原位点,且M蛋白上有9个高度保守的半胱氨酸;与参考毒株相比,IBV-W株M基因的核苷酸同源性为88.2%～92.7%,推导的氨基酸同源性为91.1%～95.6%;M蛋白的突变主要发生在前16位氨基酸,其中第2位缺失1个氨基酸,第3～6位连续插入4个氨基酸,第8～9位缺失2个氨基酸,第14～16位的3个氨基酸发生连续突变,其他位点的氨基酸变异为点突变,M蛋白核苷酸序列的变异主要表现为静默突变,亲水区较疏水区更易变易;在系统发生进化树中,W株与BJ株处于同一个小的分支上,亲缘关系较近,而与其他参考株的亲缘关系较远.[结论] 推测W株可能是一个新的变异株.
鸡传染性支气管炎病毒(IBV)、M基因、分子特征
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S858.315.3;Q785(动物医学（兽医学）)
河南省科技攻关项目0424050015;陕西省自然科学基金项目SJ08C110
2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
27-33
