糖尿病性心肌病小鼠心肌线粒体circRNA表达谱与功能富集分析

摘要：

目的 探索糖尿病性心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)小鼠心肌线粒体 circRNA的差异表达情况及其功能分析.方法 以 16 周龄的 db/db小鼠构建 DCM小鼠模型,C57 BL/KsJ 小鼠作为对照.提取两组小鼠心肌组织RNA,高通量测序筛选两组差异表达的线粒体 circRNA,使用 RT-qPCR 对差异表达显著的前 10 个 circRNA 验证测序结果,并对差异表达 circRNA靶基因作功能富集分析,使用 miRNA靶标预测软件对 circRNA-miRNA共表达网络分析.结果 与对照组比较,DCM组小鼠心肌中 147 个差异表达的线粒体 circRNA,其中高表达 89 个、低表达 58个.差异表达 circRNA 在组织中的表达变化与测序结果趋势一致.GO 与 KEGG 富集分析显示,差异表达的circRNA靶基因主要富集在 cGMP/PKG、胰高血糖素等通路,与线粒体能量代谢、心肌肥大相关.circRNA-miRNA共表达网络分析发现,表达上调最显著的 chrM:1207-1536+与 miR-491-3p、miR-99a-3p、miR-99b-3p 有关联,表达下调最显著的 chrM:1453-3205+与 miR-181b-1-3p、miR-181b-2-3p、miR-672-5p 有关联.结论 DCM小鼠心肌线粒体存在差异表达的 circRNA,且可能与相应 miRNA相互作用,通过调节能量代谢、凋亡等通路影响心肌纤维化、心肌细胞肥大,从而参与DCM的发病.

关键词：糖尿病性心肌病、线粒体、circRNA

所属期刊栏目：44

分类号：R34(人体生物化学、分子生物学)

在线出版日期：2023-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：701-708