GSTM5在前列腺癌中的表达及其对前列腺癌进展的潜在机制
目的 基于生物信息学方法探究正常前列腺和前列腺癌(PCa)组织中的差异表达基因,筛选出可能作为PCa潜在生物标志物的基因,为后期临床医学提供科学依据.方法 从GEO数据库下载GSE55945、GSE46602和GSE69223三个基因芯片数据集,通过联川生物云平台筛选差异表达基因(DEGs),使用STRING构建DEGs的蛋白质-蛋白质互作网络(PPI),导入Cytoscape后利用CytoHubba插件筛选MCC评分前30位的基因作为关键基因(Hub基因),利用DAVID对关键基因进行GO和KEGG富集分析,采用GraphPad Prism软件绘制ROC曲线,利用GEPIA数据库对关键基因进行验证,并进一步进行生存分析,利用UALCAN验证关键基因的表达与PCa Gleason分级是否有相关性.结果 GSE55945、GSE46602和GSE69223三个数据集分别得到428、727和1285个差异表达基因.韦恩(Venn)图显示三个数据集中包含的DEGs有105个.105个DEGs对应的PPI网络中筛选MCC评分排名前30位的基因作为Hub基因,其所涉及的生物过程主要包括蛋白激酶B信号的正向调节、细胞分化、转录的正调控、转化生长因子β受体信号通路负调控、细胞迁移的正向调节等,所涉及的通路为粘着斑、雌激素信号通路等.ROC曲线结果显示CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、SLC7A11、GSTM2、GSTM3、GSTM5、MYO6共9个基因同时在3个数据集中的诊断能力有统计学意义.9个Hub基因通过GEPIA网站验证显示,其中CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、GSTM2、GSTM3、GSTM5在PCa中呈低表达,而SLC7A11、MYO6在PCa中呈高表达,生存分析提示GSTM5高表达时PCa患者OS延长.UALCAN结果显示,GSTM5基因的表达与Gleason分级有明显相关性,并且随着Gleason评分的增加,GSTM5基因的表达不断降低.结论 9个Hub基因中,CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、GSTM2、GSTM3、GSTM5在PCa中呈低表达,而SLC7A11、MYO6在PCa中呈高表达,其中GSTM5基因与PCa生存率有关,并随着Gleason评分增加,GSTM5基因的表达降低,提示GSTM5可能作为PCa潜在的生物标志物.
GSTM5、前列腺癌、关键基因、生物信息学
44
R737.25(肿瘤学)
陕西省科技厅重点研发项目;咸阳市重点研发项目;陕西中医药大学研究生创新项目;咸阳市重点研发项目
2023-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
100-106
