脂肪酸代谢相关基因预后模型在肾透明细胞癌中的应用

摘要：

目的 探索基于脂肪酸代谢相关基因的预后模型在肾透明细胞癌患者中应用的可行性.方法 下载TCGA数据库中肾透明细胞癌组织及癌旁组织mRNA表达矩阵,R语言筛选差异表达的脂肪酸代谢相关基因,结合患者生存数据,利用多元Cox比例风险回归模型建立脂肪酸代谢相关多基因预后模型,计算患者的风险评分(risk score,RS),按RS的中位数将患者分为高、低风险组,利用Kaplan-Meier生存曲线分析高、低风险组之间患者的生存差异.将RS与临床病理因素纳入Cox回归分析,验证RS是否为影响患者生存的独立危险因素.受试者工作特征(ROC)曲线评估基于脂肪酸代谢相关基因的预测模型的准确性.比较RS及其相关基因在各临床病理因素分组中的差异.GSEA富集分析比较筛选高、低风险组中的KEGG差异基因集.结果 共筛选出4个差异基因(CPT1B、HADH、CYP4A11、ACADSB)建立肾癌脂肪酸代谢相关基因预后模型.预后风险评分(RS)公式为:RS=0.490×CPT1B-0.428×HADH-0.11×CYP4A11-0.372×ACADSB.低风险组的患者预后较好(P<0.001).RS是影响肾透明细胞癌患者预后的独立危险因素(P<0.01).基于肾透明细胞癌脂肪酸代谢相关基因模型计算的RS的5年生存ROC曲线AUC为0.802.GSEA分析筛选出在低风险组81个差异基因(FDR<0.25,normalizedP<0.05).结论 肾癌脂肪酸代谢相关多基因预后模型能够比较准确预测肾透明细胞癌患者的预后.

关键词：肾细胞癌、预后、脂肪酸代谢基因、TCGA数据库、Cox比例风险回归模型

所属期刊栏目：43

分类号：R737.11(肿瘤学)

资助基金：陕西省一般项目;陕西省重点项目

在线出版日期：2022-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：684-690