基于网络药理学和生物信息学的姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的机制研究

摘要：

目的 通过网络药理学和生物信息学挖掘并验证姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的作用机制.方法 从PharmMapper、GeneCards数据库筛选肾透明细胞癌和姜黄素共同靶点基因;应用TCGA数据库数据分析筛选出在肾透明细胞癌组织样本和正常组织样本中的差异表达并影响预后的共同靶点基因;利用STRING平台构建姜黄素-肾透明细胞癌靶点交互网络(protein-protein interaction,PPI);利用R软件对上述筛选靶点蛋白进行GO生物过程分析及KEGG通路富集分析;姜黄素和(或)活性氧抑制剂N-乙酰基-L-半胱氨酸(N-acetyl-L-cysteine,NAC)作用于肾癌786-O、ACHN细胞后,通过CCK8检测不同浓度姜黄素对细胞增殖及细胞活力影响,通过活性氧检测试剂盒(2′,7′-dichlorodihydrofluorescein diacetate,DCFH-DA)检测细胞内活性氧水平,丙二醛(malondialdehyde,MDA)测定试剂盒测定细胞内MDA变化.结果 PharmMapper网站及GeneCards数据库筛选出姜黄素和肾癌共同靶点109个;TCGA数据库数据分析筛选出37个差异基因可能影响患者的总体生存期;PPI筛选出姜黄素抑制肾透明细胞癌生物学行为的核心靶标蛋白主要涉及CASP3、EGFR、CHEK1、HSP90AA1、AR等.GO富集分析确定213个条目,主要包括活性氧代谢过程、对类固醇激素的反应、纤维蛋白溶解等生物活性过程;KEGG富集分析确定24个条目,主要涉及丙酮酸代谢、糖酵解/糖异生、FoxO信号通路、大肠癌、酪氨酸代谢、IL-17信号通路、细胞凋亡等信号通路;姜黄素以时间和剂量依赖性方式降低了786-O、ACHN的细胞活力(P<0.05);姜黄素处理肾癌细胞后活性氧水平及MDA水平显著升高(P<0.05);加入NAC后逆转了姜黄素对786-O和ACHN细胞的细胞活力影响(P<0.05).结论 姜黄素可能参与氧化应激途径抑制肾细胞癌的增殖.

关键词：肾透明细胞癌、姜黄素、氧化应激、增殖、网络药理学、生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：R737.11(肿瘤学)

资助基金：陕西省自然科学基础研究计划项目No.2020JQ-945

在线出版日期：2022-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：278-285