基于生物信息学分析SOX12在口腔鳞状细胞癌中的表达及验证

摘要：

目的 通过生物信息学分析转录因子SOX12在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达,进一步探讨其与OSCC临床病理特征的关系,阐明SOX12对OSCC早期诊断及预后的影响.方法 运用GEPIA数据库结合TCGA数据库分析SOX12在OSCC组织中的表达水平,并通过qRT-PCR进行体外验证;利用LinkedOmics数据库描述SOX12表达与OSCC临床病理学参数的相关性及对预后的影响;从String-DB数据库中分析SOX12在信号转导中的位置及与其关系密切的上下游基因.结果SOX12在OSCC中呈高表达,且与OSCC病理分级、T分期、N分期呈正相关;TCGA分析显示,SOX12的表达与OSCC患者术后总体生存率有关;与SOX12相互作用的蛋白有POU3F1、POU3F2、POU3F3、MYT1L、NRSN2等,主要参与神经元的分化和发育等功能.结论SOX12在OSCC中呈高表达,并与OSCC多个病理性指标相关.

关键词：口腔鳞癌、SOX12、数据库分析

所属期刊栏目：41

分类号：R739.8(肿瘤学)

资助基金：西安交通大学基本科研项目No.xzy012019088

在线出版日期：2020-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：64-68