结合吸烟与遗传因素交互作用鉴定骨质疏松症易感基因

摘要：

目的 系统分析吸烟与骨质疏松症间的交互作用,挖掘互作基因,阐明吸烟影响骨质疏松症的功能机制.方法 整合基因表达谱数据,通过双因素方差分析挖掘吸烟和骨质疏松症遗传因素互作基因,并结合通路富集分析挖掘功能性骨相关代谢通路.利用 GWAS芯片,通过基因环境互作分析验证功能通路内互作基因,最后利用蛋白网络分析发掘互作基因参与的核心调控网络.结果 表达谱分析鉴定了441 个同时与吸烟和骨质疏松症密切相关的风险基因;通路富集分析揭示了吸烟调控骨质疏松症的潜在关键代谢通路—间隙连接;通过全基因组基因环境互作分析,我们验证了多个潜在关键风险基因,并且通过蛋白网络分析揭示了 1 个包含 13 个蛋白的潜在吸烟骨质疏松症互作核心调控网络.结论 本研究发现了 1 个潜在的吸烟影响骨质疏松症的分子调控模型,对于相关疾病机制认识及后续药物靶点开发提供了新思路.

关键词：骨质疏松、吸烟、基因表达谱、双因素方差分析、基因环境互作、间隙连接

所属期刊栏目：39

分类号：R580(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31471188;陕西省自然科学基础研究计划项目No.2016JQ3026.Supported by the National Natural Science Foundation of China31471188;the Natural Science Basic Research Plan of Shaanxi Province2016JQ3026

在线出版日期：2018-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：589-596