炎症通路在强直性脊柱炎发病中作用的转录组学研究

摘要：

目的:研究强直性脊柱炎(AS)的转录组学以阐释该疾病发病中涉及的关键基因和通路.方法:收集AS患者及健康对照外周血单个核细胞,提取RNA,通过高通量RNA测序的方法得到基因表达谱.采用生物信息学方法,比较AS患者及健康对照者的基因表达情况,选差异基因,并进行GO功能注释、KEGG通路富集分析、蛋白互相作用网络分析(PPI)及表型分析.并用ELISA方法在AS患者和健康对照者外周血中进一步验证通路中涉及的重要细胞因子的水平.结果:AS患者和健康对照者存在153个差异表达基因(DEGs),其中149个基因上调,4个基因下调,这些基因相互之间密切联系.通过上调基因的生物功能分析后发现,其主要与TNF信号通路、趋化因子信号传导等炎症通路相关.另外,在外周血浆中验证到,AS患者较健康对照者炎症细胞因子IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α和IFN-γ的表达水平显著升高(P<0.05).结论:TNF、趋化因子信号传导等信号通路以及IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α和IFN-γ等炎症因子与AS发病有关.

关键词：强直性脊柱炎、RNA测序、炎症

所属期刊栏目：49

分类号：R593.23(全身性疾病)

资助基金：浙江省医药卫生科技计划项目2019RC050;温州市科技计划项目Y20160028

在线出版日期：2020-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：872-877