HPV58型E6蛋白B细胞表位预测与分析

摘要：

目的:预测分析高危型人乳头瘤病毒(HPV)58型E6蛋白的B细胞线性表位及其结构.方法:从瑞士生物信息研究所提供的Swissprot蛋白质数据库中检索到E6蛋白序列,采用计算机辅助生物信息学软件进行分析,用Expasy服务器在线软件分析预测E6蛋白的理化性质、二级结构及三维空间结构,采用DNA-STAR软件包中的protean软件进一步分析亲水性、柔韧性、表面可及性、抗原性与极性等特性,再结合氨基酸抗原指数(AI)计算法算出平均AI,根据AI大小预测HPV58型E6蛋白的B细胞线性表位的可能肽段,并进行同源性匹配分析.结果:HPV58型E6蛋白的B细胞线性表位可能位于以下肽段位置:N端8～15(KPRTLHDL)、27～44(ELKCVECKKTLQRSEVYD)、108～127(RPLCPQEKKRHVDLNKRFHN)、141～147(RPRRRQT)肽段及其周围.同源性分析得出肽段27～44、141～147为可能的B细胞线性表位,为HPV58型E6蛋白B细胞表位的独特序列,肽段8～15与HPV33型E6蛋白同源性匹配为100％,108～127与HPV33型E6、HPV9型E6蛋白同源性匹配为100％.结论:27～44、141～147肽段为可能的HPV58型E6蛋白的B细胞优势表位.

关键词：HPV58型、E6蛋白、B细胞表位预测、生物信息学分析

所属期刊栏目：48

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81176423

在线出版日期：2018-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：547-551