高通量全基因组测序法对尿道致病性大肠埃希菌NB8株毒力因子数据的初步分析

摘要：

目的：调查1株尿道致病性大肠埃希菌（UPEC）NB8株携带的毒力因子和可能存在的致病机制。方法：UPEC NB8株分离自2012年4月宁波市第一医院住院患者尿液标本，做16SrDNA和gyrA基因测序BLASTn比对确认为UPEC，用Illumina HiSeq与Ion Torrent PGM这2种大规模并行测序仪进行全基因组分析，再进行人工测序补缺口。再对NB8株做毒力因子数据挖掘和分析，最后把NB8株和9株全基因组测序的UPEC的毒力因子做比较基因组学研究。结果：UPEC NB8株全基因组测序得到一条推定的染色体序列，长4550369 bp（内含14个缺口）。推定的质粒序列，长635377 bp（内含33个缺口）。NB8株全基因组中挖掘出黏附（黏附素、P菌毛、1型菌毛、大肠埃希菌共同菌毛）、铁摄取系统（产气菌素、血红素摄取、肠杆菌素）、蛋白酶（分泌自转运毒素）、毒素（溶血素）、抗原43、SHI-2毒力岛等多种毒力因子。结论：UPEC NB8株中检出的多种毒力因子可能会在细菌黏附、侵袭、溶细胞活性、细胞毒性等方面起着重要作用，并能增强细菌的生存能力和致病力，导致宿主的泌尿道感染。全基因组测序技术具有超高速、高通量、低成本和高效益的优势，值得推广。

关键词：大肠埃希菌、全基因组、多药耐药、尿道致病性、毒力因子

所属期刊栏目：46

分类号：R378.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：宁波市自然科学基金资助项目2012A610186；浙江省中医药资助项目2011ZB126。

在线出版日期：2016-12-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：798-806