miRNA转录组学分析镉致小鼠睾丸间质细胞毒性作用机制

摘要：

目的 运用转录组测序及生物信息学技术,探讨镉通过调控微小RNA(microRNA,miRNA)引起小鼠睾丸间质细胞(TM3)毒性的机制.方法 选取TM3为细胞模型,分为对照组(不予镉处理)和镉染毒组(20 μmol/L CdCl2),24h后收获细胞提取总RNA,通过RNA质量检测后上机执行测序程序得到miRNA的表达谱.以差异倍数(fold change,FC)＞2,P＜0.05作为标准筛选显著差异表达miRNA,并采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)对差异表达miRNA进行验证.同时,利用miRanda软件预测其靶基因,构建miRNA-靶基因互作网络并对靶基因进行基因本体学(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析.结果 筛选出镉致TM3细胞毒性相关的26个显著差异表达miRNA,其中19个显著上调,7个显著下调.qRT-PCR对其中3个差异miRNA进行表达量的验证,结果与转录组测序相一致.生物信息学分析结果显示:26个差异表达miRNA共预测到657个靶基因,GO富集主要归类于生物调控、代谢过程、蛋白结合和催化活性等方面;KEGG通路注释表明靶基因主要富集于丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等与炎症反应、细胞凋亡密切相关的经典信号通路(P＜0.05).结论 镉可导致TM3细胞差异表达miRNA,其靶基因可能通过MAPK、TNF等信号通路参与镉引起的TM3细胞毒性.

关键词：镉、毒性、TM3细胞、miRNA、转录组测序

所属期刊栏目：52

分类号：R114;R994.6(卫生基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;江苏省研究生科研与实践创新计划项目

在线出版日期：2023-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：483-488,505