硒蛋白P的结构与功能预测

摘要：

目的 预测硒蛋白P的结构和功能.方法 利用生物信息学方法 分析硒蛋白P的氨基酸疏水性、跨膜螺旋、二硫键的形成、氨基酸残基相对可及性和二级结构的组成及外显子对应的肽序列,利用SmithWaterman法在EMBL蛋白数据库中对硒蛋白P进行同源性比对,ScanProsite程序在PROSITE数据库中搜索硒蛋白P中的基序,SMART服务器搜索结构域.结果 成熟的硒蛋白P有两个跨膜螺旋,由四个模块组成:M1(Glu20-Ser67/Lys68)、M2(Ser67/Lys68-Asp138/Arg139)、M3(Asp138/Arg139-Thr178),和M4(Thr179-Asn381);在M2中有一螺旋的螺旋结构,其中的规则二级结构高于其他三个模块,在M1、M3、M4中环形(loop)结构含量较高,M4含有富含组氨酸的序列(His204-His57)且该序列位于硒蛋白P的表面;氨基酸溶剂可及性分析表明成熟的硒蛋白P不是球形结构.几种在脑的发育中起重要作用的蛋白HUNB SCAAL、ZP12 BRARE、BR11BRARE,和BRN1 HUMAN与硒蛋白P有同源性,这种同源性可能是对脑的特异性;另外两个同源性蛋白是KNOB PLAFG和HPN HELPY,KNOB PLAFG能锚定于内皮细胞受体与血小板反应蛋白形成的复合物上,而HPN HELPY对镍和锌有强烈的结合特性.结论 硒蛋白P有金属结合活性及与内皮细胞的重要关系,结果 还显示硒蛋白P对脑的作用相对更重要.

关键词：硒蛋白P、结构、功能

所属期刊栏目：33

分类号：Q513(蛋白质)

在线出版日期：2005-01-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：572-574