瘤胃微生物RNA提取中样品前处理方法的优化

摘要：

通过优化瘤胃液前处理方法,提高瘤胃微生物RNA提取数量与质量.试验优化4个前处理条件,共组合形成5个处理组.前处理完成后,利用Trizol进行RNA提取,检测RNA浓度和完整度(RIN).结果 显示,提取瘤胃内容物和瘤胃菌体RNA浓度和完整度的影响没有显著差异(P＞0.05).液氮保存的样品提取的RNA浓度和完整度均显著(P＜0.05)高于RNA保护液保存的样品.解冻处理对RNA浓度的影响无显著差异(P＞0.05),但是不解冻处理提取的RNA完整度显著高于解冻处理(P＜0.05).液氮冷冻研磨提取的RNA浓度(P＜0.05)显著高于常温研磨,但是对RNA完整度的影响没有显著差异(P＞0.05).瘤胃内容物、液氮速冻、不解冻处理结合冷冻研磨方法所提取RNA的RIN值为9.43,完整度最高.瘤胃内容物、液氮速冻、解冻离心收集菌体结合冷冻研磨方法所提取的RNA浓度为1 048 ng/μL,为最高浓度.因此,瘤胃内容物直接液氮速冻并在不解冻条件下冷冻研磨,所提取的RNA效果最好,可用于后续宏转录组学试验.

关键词：瘤胃液、前处理、破碎温度、RNA提取、优化、RNA质量

所属期刊栏目：40

分类号：Q939.94(微生物学)

资助基金：国家重点研发计划项目;国家自然科学基金项目;中国农业科学院农业科技创新工程重大产出科研选题项目;中国农业科学院科技创新工程项目

在线出版日期：2020-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：88-93