基于主成分特征投影法建立利用16S rRNA基因序列进行物种分类方法的研究

摘要：

提出一种有别于系统发育树的根据16S rRNA基因序列进行物种分类的新方法.首先将基因的碱基字母形式转换成数字形式,构建多维向量.然后根据主成分分析方法将该向量向数据分布最大方向投影,将原数据用几个“主成分”线性袁出,而不丢失原数据的信息,采用主成分的显示功能作出三维主成分特征投影视图,达到分类的目的.在双歧杆菌和肠球菌的分类识别中得到较好的应用.

关键词：物种分类、碱基序列、向量、主成分分析

所属期刊栏目：35

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目BS2011SW005;山东省科技公关基金项目2007GG3WZ05009

在线出版日期：2016-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：105-108