基于元基因组学数据集的海洋微生物多样性分析

摘要：

通过对海洋13个样品元基因组数据的BLAST搜索,筛选到了16S rRNA基因序列1 600条,18SrRNA基因序列61条.分类结果显示,细菌在海岸、公开海域深层海水和表层海水3种海洋环境类型中都占优势,其相对百分比分别为98％、59％和91％.相比于海岸和公开海域表层海水,公开海域深层海水中古生菌和Deltaproteobacteria所占的相对含量较高,各31％和27％.海岸检测到的古生菌主要为Euryarcheata,公开海域深层海水检测到的古生菌主要为Crenarchaeota(93％为与氨氧化相关的MGI纲).结果表明,氨氧化相关古生菌在深海生态系统中的作用可能较大.

关键词：元基因组、海洋、细菌、古生菌、真核生物

所属期刊栏目：34

分类号：Q938(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目31170114

在线出版日期：2015-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：8-12