基于转录组解析淡玫红鹅膏环肽基因家族特征及其系统发育

摘要：

[背景]淡玫红鹅膏(Amanita pallidorosea)是鹅膏属檐托鹅膏组的一种剧毒鹅膏菌,其子实体内含有丰富的鹅膏环肽毒素,但其编码毒环肽和相关肽的基因家族"MSDIN"尚待深入研究.[目的]探究淡玫红鹅膏中编码毒环肽及相关肽的基因家族成员的多样性、保守性及其系统发育.[方法]采用Illumina HiSeq 2000平台对淡玫红鹅膏转录组进行测序,使用TBLASTn软件对MSDIN基因家族进行检索,并设计特异性引物进行PCR验证,通过生物信息学比对分析MSDIN基因家族成员的种类和序列构成,通过重建分子系统发育树了解其演化历程.[结果]通过对MSDIN基因家族的查找,从转录组数据获得了60条环肽编码基因,经PCR验证其可编码32条环肽,包括α-鹅膏毒肽、β-鹅膏毒肽和羧基二羟鬼笔毒肽.本研究报道了8条新环肽.分子系统发育树分析显示,鹅膏环肽分为鹅膏毒肽、鬼笔毒肽和未知功能环肽3大支.系统发育结合保守序列推测出7条潜在的新毒肽.[结论]淡玫红鹅膏具有丰富的鹅膏环肽资源,利用转录组测序能够系统挖掘鹅膏环肽新资源,为其整体结构解析奠定基础.

关键词：鹅膏属;剧毒蘑菇;毒肽基因;保守序列;系统发育分析

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资助基金：广州市科技计划重点项目;国家自然科学基金;广东省科技计划;广东省科技计划;广东省科技计划

在线出版日期：2022-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共18页

页码：4799-4816