植物乳杆菌PC518质粒pLP224的发现以及pMV158家族质粒的保守性和多样性分析

摘要：

[背景]植物乳杆菌含有丰富的天然质粒,分析这些质粒的序列特征有利于分析质粒所携带的遗传信息.[目的]分析从植物乳杆菌PC518分离的新质粒pLP224,聚类分析其所属家族质粒的保守性与多样性.[方法]提取植物乳杆菌PC518的质粒,酶切后构建质粒DNA文库,测序和BLAST鉴定文库中的新序列;通过反向PCR完成质粒全序列测定,注释新质粒;使用进化树软件MEGAX构建质粒的Rep蛋白进化树,并分析结合序列的变化.[结果]从植物乳杆菌PC518分离出一个质粒pLP224,大小为1 766 bp,其中(G+C)mol％含量为41.39％,与已知质粒的最大序列相似性为86.85％.推定其复制方式为滚环复制,属于pMV158家族成员.17个pMV158家族质粒的Rep蛋白分析表明:pMV158家族质粒的Rep蛋白进化距离越近,其dso位点的结合序列相似性越高,进化距离越远则其序列相似性越低.[结论]pLP224是pMV158家族的新成员.pMV158家族质粒在dso位点的切开序列上保守,在结合序列上多样.其Rep蛋白随结合序列变化而不同.这种差异有利于pMV158家族不同成员在同一宿主的共存,是家族成员持续存在并稳定进化的基础.

关键词：植物乳杆菌、质粒、滚环复制、pMV158家族、Rep蛋白、结合序列

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资助基金：四川省卫生和计划生育委员会科研课题17PJ494

在线出版日期：2021-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：4309-4316