辣椒疫霉菌果胶裂解酶PL101基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

[背景]辣椒疫病是一种世界性土传病害,严重影响世界各国辣椒生产,并带来巨大经济损失.果胶裂解酶(pectate lyase,PL)作为一类重要的细胞壁降解酶类是该病的重要致病因子.[目的]对果胶裂解酶基因进行克隆,并对其生物信息学特性进行相关分析,进一步阐明该酶的作用机制.[方法]根据辣椒疫霉菌全基因组序列,以高致病菌株SD33为模板扩增PL101基因的全长cDNA序列,并对其理化性质、跨膜区、亲疏水性、结构域等生物学特性进行分析.[结果]除获得PL101相关生物学特性信息外,还对PL101进行三维结构建模,获得可信度较高的蛋白结构,并确定PL101可能的催化位点为Asp183、Arg212、Arg272三个氨基酸.[结论]对PL101基因的克隆及相关生物学特性的分析为进一步阐明PL功能特性提供参考.

关键词：辣椒疫霉菌、果胶裂解酶、克隆、生物信息学

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资助基金：淄博市重点研发计划;淄博市科技发展计划;山东省引进顶尖人才"一事一议"专项经费资助项目

在线出版日期：2021-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：4021-4028