异育银鲫养殖环境典型病原微生物检测和细菌群落解析

摘要：

[背景]水产养殖病害是限制淡水渔业发展的一个重要因素,养殖环境的微生物状况与鱼类健康紧密相关,已引起人们广泛关注.[目的]阐明养殖水体和沉积物中病原微生物丰度和细菌群落多样性变化特征.[方法]利用荧光定量 PCR方法和未端限制性片段长度多态性(Terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)技术,对异育银鲫养殖环境水体和沉积物中的典型病原微生物进行定量检测,以及细菌群落多样性分析.[结果]养殖过程中病原菌丰度呈现不同的变化趋势,嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)、温和气单胞菌(A.sobria)和维氏气单胞菌(A.veronii)与鲤疱疹病毒Ⅱ型丰度变化呈显著正相关.水体中病原菌丰度受 pH、温度和溶解氧等环境因子的影响显著.T-RFLP分析表明沉积物样品较水体样品细菌群落组成复杂,并且沉积物细菌群落动态变化幅度高于水体.水体和沉积物中细菌 T-RFs数量范围分别在 11-29 和 20-32 之间,Shannon-wiener指数在1.44-2.87和 2.44-3.25之间.[结论]养殖水体中的病原菌丰度高于沉积物,而沉积物细菌群落丰富度和多样性高于水体.病原菌丰度和细菌群落结构变化与环境因子密切相关,明确养殖池塘环境中病原微生物的生态分布和丰度变化,将为指导养殖过程中病原性疾病发生早期预警提供理论依据.

关键词：养殖环境、定量PCR、末端限制性片段长度多态性、病原微生物、微生物群落

所属期刊栏目：46

资助基金：国家重点研发计划;中国农业科学院农田灌溉研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费

在线出版日期：2020-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：3363-3377