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10.13344/j.microbiol.china.170406

16S rRNA基因高通量测序法分析黄河太岁细菌的多样性

引用
[背景]太岁在我国的记载由来已久,《神农本草经》记载其具有扶正固本、轻身不老的功效.但是,太岁作为一种生物体,它的组成分类尚不明确,因而其药用价值得不到有效的科学验证.因此,利用各种生物技术和手段来客观地分析太岁的成分,为利用和开发太岁提供科学依据.[目的]检测太岁(编号D15112285)中所含细菌的种类,探究太岁中可能存在的原核微生物的种类及其之间的关系.[方法]采用Illumina MiSeq2×250系统对黄河太岁的细菌16SrRNA基因(V4区)进行研究,利用FLASH等软件对数据进行分析.[结果]共获得OTU (Operational taxonomical unit) 626条,涉及19门49纲80目107科112属.在属的水平上前十的优势菌群有Bacteroides、Coprococcus、Escherichia、Ruminococcus、Lactobacillus、[Ruminococcus]、Oscillospira、Faecalibacterium、Shewanella和Halomonas.[结论]黄河太岁中存在多种不同种类的细菌.

黄河太岁、测序、物种注释、细菌

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河北省中医药管理局项目2015008;中国中医科学院科技基础性工作专项项目2013FY114500;河北省现代农业产业技术体系中药材产业创新团队项目7002017012013;Program of Administration of Traditional Chinese Medicine of Hebei Province2015008;Science and Technology Basic Research Program of China Academy of Chinese Medical Sciences2013FY114500;Industrial Innovation Team Program of Traditional Chinese Medicine of Modern Agricultural Industry Technology System of Hebei Province7002017012013

2018-08-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共9页

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0253-2654

11-1996/Q

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2018,45(4)

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