环磷酸腺苷对太湖界面沉积物可培养细菌多样性的影响

摘要：

[背景]环境细菌可培养率只有1％,菌间的信息交流是限制培养效率的一个重要原因.细胞间信息传递的“第二信使”——环磷酸腺苷(cAMP)是细菌感知和应对外界变化时使用广泛的物质.[目的]研究cAMP诱导培养下的细菌种群组成变化,以探讨对微生物可培养性的影响,为提高细菌可培养率和菌种资源开发提供参考.[方法]以太湖沉积物为对象,结合高通量测序和分离培养方法解析样品中细菌的多样性.[结果]高通量测序的物种组成分析结果表明,cAMP作用下诱导出60个不同于对照组的OTU (Operational taxonomic unit),其中显著差异的是变形菌门和拟杆菌门,前者提高4.08％,后者降低3.36％,非常显著差异的是疣微菌门.在属分类水平有8个显著差异的菌属,2个非常显著差异的菌属(气单胞菌属和Trichococcus).分离培养结果显示,cAMP诱导下CFU (Colony-forming unit)提高至1.6倍,诱导培养出微小杆菌属(Exiquobacterium)、微杆菌属Microbacterium)、热单胞菌属(Thermomonas)、Lacibacter、Pedobacter、Massilia、Kocuria和Arthrobacter.[结论]从高通量结果可知cAMP对变形菌门的菌株生长有显著促进作用,而分离培养结果表明,cAMP提高微小杆菌属、微杆菌属、热单胞菌属、Lacibacter、Pedobacter、Massilia、Kocuria和Arthrobacter的可培养性.

关键词：细菌、可培养率、cAMP、高通量测序、沉积物

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资助基金：National Natural Science Foundation of China31370147,31400103;Program for Innovative Research Team in Science and Technology in University of Henan Province 15IRTSTHN019国家自然科学基金31370147,31400103;河南省高校科技创新团队支持计划15IRTSTHN019

在线出版日期：2018-04-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：284-292