植物内生固氮菌系统发育进化新进展

摘要：

在植物内生固氮菌系统发育进化关系研究中,常用的方法有形态学与蛋白质水平法、数值分类和自动化鉴定法、化学分类法、分子遗传学方法等.本文简要介绍了常用方法的关键技术,并归纳了它们的优缺点.生物学的研究进入基因组时代后,随着高通量DNA测序技术在微生物学领域应用的迅速发展,全基因组测序被应用到微生物系统发育进化研究中,然而目前并未发现对已测全基因组序列的植物内生固氮菌进行系统总结.本文在对已测序植物内生固氮菌进行归纳的基础上,又详细研究了基于基因组数据的几种具有代表性的新方法(ANI分析法、最大唯一匹配指数法、核心基因组分析、组分矢量法、基因流动性分析),并结合目前系统发育进化研究常用方法,对植物内生固氮菌系统发育进化研究趋势进行总结和展望,旨在使植物内生固氮菌的系统发育进化关系研究在精确度、可靠性等方面有所突破.

关键词：内生固氮菌、系统发育进化、高通量测序、基因组分析方法

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资助基金：National Natural Science Foundation of China31370052;Natural Science Foundation of Guangdong Province2014A030313459,2014A050503058;National Natural Science Foundation of China-Guangdong Joint FundU1401234;Tobacco Monopoly Bureau Project of Guangdong Province Guangdong Tobacco Department [2012] 26国家自然科学基金项目31370052;广东省科技项目2014A030313459,2014A050503058;NSFC-广东联合基金项目U1401234;广东省烟草专卖局公司科技项目粤烟科[2012]26

在线出版日期：2018-03-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：181-190