与PRRSV nsp11互作的宿主细胞蛋白鉴定及生物信息学分析

摘要：

[目的]研究猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV) nsp11与宿主细胞蛋白之间的相互作用,对于揭示nsp 11在病毒复制过程中发挥的功能至关重要.[方法]在病毒感染细胞的基础上,利用nsp 11的单克隆抗体,采用免疫沉淀结合串联质谱的方法,筛选与PRRSV nsp 11相互作用的宿主细胞蛋白,并对所筛选出的宿主细胞蛋白进行了GO注释、COG注释和KEGG代谢通路注释;选取筛选出的宿主细胞蛋白IRAK1,利用免疫共沉淀技术和激光共聚焦技术鉴定其与nsp 11之间的相互作用.[结果]与空白对照组相比,病毒感染组中出现3条差异带;经质谱分析共筛选得到了201个与nsp 11相互作用的宿主细胞蛋白,分别与蛋白质代谢、细胞信号通路转导以及病原致病性等密切相关;在生物信息学分析的基础上,实验验证了nsp 11确与宿主细胞蛋白IRAK1进行相互作用.[结论]鉴定出与PRRSV nsp 11相互作用的宿主细胞蛋白,生物信息学分析显示它们在病毒的复制和致病过程中发挥重要作用.研究结果为探究nsp11的生物学功能指明了方向,也为研究宿主细胞蛋白与病毒蛋白间的相互作用及其调控病毒复制和致病性的分子机制奠定了基础.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒、非结构蛋白11、宿主细胞蛋白、相互作用、生物信息学分析

所属期刊栏目：44

分类号：R31;R3

资助基金：National Key Technologies R&D Program of China No.2015BAD12B01-2国家科技攻关计划项目2015BAD12B01-2

在线出版日期：2018-01-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：2856-2870