大熊猫肠道放线菌的种群组成及多样性分析

摘要：

[目的]探究不同年龄、不同性别大熊猫肠道放线菌的多样性及群落结构,为寻找潜在产生活性化合物的放线菌资源提供理论依据.[方法]采用PCR-DGGE技术对大熊猫肠道放线菌进行分析,对电泳结果进行UPGMA聚类分析、主成分分析、生物多样性等多重比较.[结果]变性梯度凝胶电泳(DGGE)图谱显示,不同大熊猫肠道中放线菌的多样性及群落结构存在明显差异.随着年龄的增长,雌性大熊猫肠道中放线菌的多样性指数(H')和丰富度(S)逐渐减少,而雄性大熊猫肠道内放线菌的多样性指数(H')和丰富度(S)逐渐增多.不同个体的大熊猫肠道放线菌的群落结构存在明显差异,但相同性别之间的相似性很高.DGGE条带回收测序结果表明,获得的28条序列归属于10个放线菌属,其中链霉菌属(Streptomyces)为优势菌属,占总数的46％;北里孢菌属(Kitasatospora)、红球菌属(Rhodococcus)、棒杆菌属(Corynebacterium)、迪茨氏菌属(Dietziaceae)、大理石雕菌属(Marmoricola)、布登堡菌属(Beutenbergia)、微杆菌属(Microbacterium)、链嗜酸菌属(Streptacidiphilus)和芽生球菌属(Blastococcus)等为非链霉菌属,占总数的54％.[结论]大熊猫肠道内蕴藏着丰富的放线菌资源,其肠道菌群的结构与组成受年龄和性别的影响.

关键词：大熊猫、肠道放线菌、多样性、变性梯度凝胶电泳

所属期刊栏目：44

分类号：S15;S48

资助基金：Students’ Innovative Experiment Plan of Sichuan Province No.1510626077四川省大学生创新性实验计划1510626077

在线出版日期：2017-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1138-1148