南海深海沉积物放线菌多样性分析

摘要：

[目的]免培养和纯培养相结合分析南海深海沉积物放线菌多样性.[方法]免培养方法通过提取沉积物宏基因组DNA,利用放线菌门特异性引物扩增放线菌16S rRNA基因序列,构建放线菌16S rRNA基因克隆文库,文库经RFLP (Restriction fragment length polymorphism)分析后挑选代表序列测序并进行多样性指数分析和系统发育分析.可培养方法利用8种培养基进行菌株分离,对排重后的菌株进行16S rRNA基因序列多样性分析.[结果]构建的两个深海位点的16S rRNA基因克隆文库在放线菌门的放线菌纲(Actinobacteria)、酸微菌纲(Acidimicrobiia)、腈基降解菌纲(Nitriliruptoria)和嗜热油菌纲(Thermoleophilia)4个纲中均有分布;两个位点中的种群结构有差异,N40-4位点的优势种群是放线菌纲的链霉菌目(Streptomycetales);N63-4位点的优势种群是腈基降解菌纲的腈基降解菌目(Nitriliruptorales).8种培养基共分离出41株放线菌,根据形态特征排重后得到的19株菌分布于10个不同的属,12个不同的种,其中稀有放线菌属比例较高,菌株OAct400为潜在的微杆菌属(Microbacterium)新种.[结论]南海深海沉积物蕴含着丰富的放线菌物种资源及大量未知种群,具有进一步研究的价值.

关键词：南海、放线菌、免培养、可培养、多样性

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资助基金：国家自然科学基金项目No.31200009,41176120;National Natural Science Foundation of China No.31200009,41176120

在线出版日期：2016-09-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1438-1447