应用PCR-DGGE和Real-Time PCR分析健康与腹泻獭兔盲肠菌群

摘要：

[目的]研究獭兔腹泻发生后盲肠菌群结构的变化情况,为微生态防治断奶兔腹泻提供理论基础.[方法]分别提取5只健康和腹泻獭兔盲肠内容物总DNA,应用PCR-DGGE及Real-Time PCR技术比较分析獭兔盲肠中菌群结构的差异.[结果]腹泻獭兔PCR-DGGE图谱条带丰富度、均匀度、多样性指数与健康獭兔相比差异均不显著,但聚类分析和主成分分析(PCA)能够将腹泻组和健康组区分开.Real-Time PCR检测显示,腹泻獭兔盲肠正常菌群普雷沃氏菌、梭菌类群Ⅰ数量与健康獭兔相比没有变化(P＞0.05);链球菌属、梭菌类群Ⅳ和XⅣa、白色瘤胃球菌、溶纤维丁酸弧菌、普拉梭杆菌等有益微生物数量显著降低(P＜0.01),而埃希氏大肠杆菌数量却显著升高(P＜0.05).[结论]獭兔腹泻发生后盲肠有益微生物数量降低,有害微生物数量升高;菌群结构有差异但不显著(P＞0.05),腹泻獭兔盲肠菌群结构有复杂化的趋势.

关键词：腹泻、肠道菌群、PCR-DGGE、Real-Time PCR、獭兔

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资助基金：The Project of Twelfth Five Year Plan of Sichuan Province No.2011NZ0099-4四川省“十二五”农作物及畜禽育种攻关项目No.2011NZ0099-4

在线出版日期：2016-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：131-139