分枝杆菌噬菌体Guo1环状基因组特征及生物学特性分析

摘要：

[目的]初步研究分枝杆菌噬菌体Guo1环状基因组特征及生物学特性.[方法]采用鸟枪法和重叠群组装策略完成Guo1全基因组测序;使用DNAStar、tRNAscan-SE、Promoter predictions、TRF、Glimmer、BLAST软件分别对噬菌体的一般基因组学特征、tRNA、启动子、串联重复序列和编码基因进行分析;运用BLAST软件检索与Guo1基因组相似的噬菌体并构建系统进化树,推断Guo1的分群;测定最佳感染复数、一步生长曲线以及对紫外线、氯仿、酒精、温度、pH的敏感性.[结果]噬菌体Guo1的基因组为全长40 086 nt的环状双链DNA,属于G群分枝杆菌噬菌体;含有59个推定基因,7个启动子序列和3个串联重复序列;Guo1对紫外线有较强抵抗性,对酒精、氯仿和高温敏感,最适温度为37℃,最适pH为7.0,最佳感染复数为0.01,潜伏期120 min,裂解期120 min,裂解量为47个.[结论]Guo1是首次发现的具有环状双链DNA结构的G群分枝杆菌噬菌体,完成了Guo1的全基因组测序,并初步分析了Guo1的基因组特征和生物学特性.

关键词：Guo1、分枝杆菌噬菌体G群、环状基因组、生物学特性

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资助基金：国家“十二五”重大专项课题No.2012ZX10003-009;国家临床重点专科专项经费资助项目No.卫办医政函[2012]649号

在线出版日期：2015-09-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1529-1538