10.13344/j.microbiol.china.140863
含好氧不产氧光合基因簇和Xanthorhodopsin-like基因的Sphingomonas sp.MIM37:基因组及光促生长分析
[目的]菌株MIM37为具有两种光能利用途径的光合异养细菌,分析其基因组和光照对生长的影响,为理解光能利用途径、光营养生物多样性以及光合作用的进化和功能等提供线索.[方法]采用平板涂布划线法分离菌株,结合形态观察及16S rRNA基因和光合基因序列同源性与系统发育分析进行初步分类鉴定;以分光光度法和荧光显微观察法测定光照和黑暗培养下培养液细胞浓度和单细胞体积;构建片段长度为300-500 bp的Illumina PE文库,以Illumina Hiseq2000进行基因组测序,以SOAPdenovo和GapCloser组装序列,以RAST在线软件注释基因组.[结果]从内蒙古腾格里沙漠天鹅湖表层水中分离获得一株细菌MIM37,经16S rRNA基因、pufM和视紫质基因同源性和系统发育分析均显示其与Sphingomonas属亲缘关系最为密切;相对黑暗培养,光照刺激下的最大细胞浓度和单细胞体积大小分别提高了1.2和5.6倍;基因组注释显示MIM37代谢途径多样,含典型好氧菌的呼吸电子传递链,具有完整的好氧不产氧细菌的光合基因簇及Xanthorhodopsin-like视紫质蛋白基因,合成铁载体,还原重金属,降解微囊藻毒素和多环芳烃类等.[结论] MIM37属于Sphingomonas属,具有两种光能利用途径,光照可明显促进其生长,多样的代谢模式可能使其在自然环境中极具竞争力、分布广泛并具有应用于修复环境污染的潜力.
好氧不产氧光合细菌、光合基因簇、视紫质、16S rRNA、pufM、基因组
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国家自然科学基金项目No.30760004;内蒙古自治区高等学校“青年科技英才支持计划”项目No.NJYT-14-A05;内蒙古农业大学科技创新团队项目No.NDTD2013-1
2015-09-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1520-1528
