iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术在草菇不同生长发育时期蛋白质组分析中的应用

摘要：

[目的]旨在采用iTRAQ标记结合二维液相色谱串联质谱技术对草菇不同生长发育阶段的差异蛋白质组进行研究.[方法]首先将提取的草菇不同生长阶段蛋白样品进行SDS-PAGE分析,其次将经二维液相色谱串联质谱技术获取的串联质谱数据通过MASCOT软件搜库,之后对鉴定蛋白质数据进行了主成分分析(Principal componentanalysis,PCA)、层次聚类(Hierarchy clustering)分析、K-均值(K-means)聚类和GeneOntology (GO)注释分析.[结果]试验结果显示,共计获得2 335个不同肽段,鉴定到1 039个蛋白质,其中1 030个蛋白质具有定量信息.在子实体阶段中显著上调蛋白质64个,下调蛋白质150个.生物信息学分析表明,iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可对不同生长发育时期的草菇蛋白样品进行有效地分离和鉴定.[结论]这一研究结果为深入研究草菇乃至其他大型担子菌子实体形成和发育的分子机制提供借鉴.

关键词：草菇、蛋白质组、iTRAQ、二维液相色谱串联质谱

所属期刊栏目：39

分类号：S646.13

资助基金：国家现代农业产业技术体系建设专项资金资助CARS24

在线出版日期：2012-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：853-864