沼泽红假单胞菌 Rhodopseudomonas palustris2-8的亚硝酸盐还原酶基因克隆和序列分析

摘要：

沼泽红假单胞菌 2-8 具有亚硝酸盐还原能力,根据不同类型亚硝酸盐还原酶保守序列设计引物,通过PCR扩增的方法对2-8菌株的亚硝酸盐还原酶类型进行鉴定,发现该菌株的亚硝酸盐还原酶为Cu型亚硝酸盐还原酶.从2-8菌株基因组中克隆出编码该Cu型亚硝酸盐还原酶的基因(nirK),该基因由1 154个碱基对组成,在GenBank数据库的登录号为GU332847,与沼泽红假单胞茵Rhodopseudomonas palustris TIE和CGA009的nirK序列相似性为90%.互联网数据库及生物信息学分析工具分析显示,该基因编码的由370个氨基酸残基组成的蛋白是铜型亚硝酸盐还原酶,属于一型多铜氧化酶,pI 6.2,是一种稳定蛋白,定位于膜外或周质;由α螺旋、延伸带、随机卷曲和模糊状态组成;有4个2Fe-2S氧化还原蛋白型铁硫结合结构域和一个4Fe-4S氧化还原蛋白型铁硫结合结构域.经Northern杂交分析显示nirK基因在沼泽红假单胞菌2-8中以单拷贝的形式存在并表达.

关键词：沼泽红假单胞菌、亚硝酸盐还原酶、Cu型亚硝酸盐还原酶、基因克隆、生物信息学

所属期刊栏目：38

分类号：Q93(微生物学)

资助基金：广东省自然科学基金项目07009702

在线出版日期：2011-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：647-653