植物乳杆菌KLDS1.0728质粒p141的分子分析

摘要：

对分离自植物乳杆菌KLDS1.0728的质粒p141进行了全序列测定,结果显示,该质粒全长为3597 bp,平均G+C mol%值为38%,并利用DNAMAN6.0软件得到该质粒限制性内切酶图谱.经NCBI网站ORF Finder软件分析确定其编码序列即ORF为15个,通过与公共数据库比对,发现可以识别功能的ORF有2个,其中包括质粒复制所必需的rep基因,p141的rep基因与已知序列的植物乳杆菌WCFS1内源质粒pWCFS101以及植物乳杆菌内源质粒pM4的复制蛋白基因相似性高达91%.根据rep基因的相似性比较,判断p141的复制模式归属于RCR模式的Group Ⅲ组,即pC194家族.另外,还发现质粒p141中存在mob基因,表明该质粒具有水平转移能力.但没有发现Tn4430转座子以及转座酶基因topl和topA,所以可以判断该质粒的基因比较稳定.此外,还发现该质粒序列中存在一定的与质粒复制和转移调控以及蛋白质表达等有关的重复序列,其对调控质粒的拷贝数有一定意义.

关键词：植物乳杆菌、质粒、序列分析

所属期刊栏目：37

分类号：Q93(微生物学)

资助基金：黑龙江省教育厅青年学术骨干基金项目资助1151G008

在线出版日期：2011-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：228-233