聚酮化合物β-酮酰-ACP合酶的计算机对比分析与组合生物合成

摘要：

为了合理地设计新的聚酮化合物提高组合生物合成的效率,本文使用ClustalW、Mega 4.0分析了26种来自不同聚酮合酶的β-酮酰-ACP合酶结构域的序列特征,并用ProtParam、Phdsec、Swiss-Model等工具对其中9种具有不同底物专一性的β-酮酰-ACP合酶的一级结构、二级结构和三级结构及活性位点进行了分析与预测.发现它们结构上的相似性大于序列上的相似性;活性位点都富含丝氨酸;底物含有2个羧酸基团的β-酮酰-ACP合酶的理论pI均小于5.0且其形式电荷总量也偏低;序列V303ELHGTGTPLGDPIEAGA320是这26种β-酮酰-ACP合酶的一段保守序列,但它并不与活性位点相邻.这些研究对进行聚酮合酶的模块或结构域替换以及定点突变具有重要的指导意义,也为探讨其的进化机制提供了参考.

关键词：聚酮化舍物、β-酮酰-ACP合酶、组合生物合成、底物专一性

所属期刊栏目：37

分类号：Q55(酶)

资助基金：国家863计划项目2006AA02Z187;国家自然科学基金项目30870064;教育部博士点基金项目20060542006

在线出版日期：2011-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：191-198