新型淡水微囊藻噬藻体vB_MweS-yong2的分离与基因组分析
[目的 ]蓝藻(cyanobacteria)水华频繁暴发,引起水质恶化,使水生生物大量死亡,给水产养殖业造成巨大的经济损失;其代谢产物藻毒素具有肝毒性、神经毒性、生殖毒性、遗传毒性和肿瘤促进作用,并可在水生生物中富集,造成饮用水安全风险和水产品食用安全风险.噬藻体(cyanophages)是一类特异性侵染蓝藻的病毒,参与调控蓝藻的种群密度和丰度,被认为是极具潜力的蓝藻水华生物防控工具.以往的研究报道多集中于海水噬藻体,有关淡水噬藻体的报道寥寥无几,迄今尚无惠氏微囊藻(Microcystis vvesenbergii)噬藻体的研究报道.本研究的目的在于分离、鉴定惠氏微囊藻噬藻体.[方法]以惠氏微囊藻FACHB-1112为指示宿主,采用双层平板法从淡水中分离出噬藻体vB_MweS-yong2,对其进行全基因组测序、基因功能注释和系统进化分析.[结果]vB_MweS-yong2的基因组长44 530bp,G+C含量为71.6%,有61个开放阅读框(ORF)、1 个 tRNA基因.成对序列比较(pairwise sequence comparison,PASC)表明,vB_MweS-yong2与所有已知噬菌体间的全基因组核苷酸序列相似度最高只有20.21%,小于<50%的属边界值.没有在vB_MweS-yong2基因组中发现抗生素耐药基因和毒力因子基因,显示该噬藻体在基因水平上的安全性.[结论]vB_MweS-yong2在有尾目的长尾科中代表一个新的属.本研究丰富了淡水噬藻体库、基因库,并为以后研发该噬藻体的功能基因、进一步研发用于治理以惠氏微囊藻为优势种引起的水华的产品与技术奠定了基础.
惠氏微囊藻、噬藻体、基因组、系统进化分析
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S852.65;Q939.48;Q78
国家重点研发计划2018YFA0903000
2022-10-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共17页
3784-3800