果实红色与黄色番茄品种植株茎部内生细菌群落结构及代谢功能特征
[目的]比较果实颜色分别为红色和黄色的番茄植株茎部内生细菌群落组成及代谢功能特征,旨在探究番茄果色形成与植株内生细菌的关联,为构建番茄育种新型的评价体系,以及开发利用有益微生物功能提供理论依据和技术支撑.[方法]基于MiSeq高通量测序技术,分析果实颜色分别为红色和黄色番茄品种植株茎部内生细菌群落组成及相关代谢功能生物信息学分析.[结果]果实颜色分别为红色和黄色番茄品种植株茎部中,短状杆菌属(Brachybacterium)、未分类大肠杆菌属(unclassified_f_Enterobacteriaceae)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、棒杆菌属(Corynebacterium)、绿脓杆菌属(Pseudomaonas)、微杆菌属(Microbacterium)、norank_f_norank_o_Gaiellales、褚氏杆菌属(Chujaibacter)、鞘氨醇单胞杆菌属(Sphigomonas)细菌是红色番茄品种植株茎部特有的优势内生细菌属;短小杆菌属(Curtobacterium)、norank_f _Mitochondria、拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)和束毛球菌属(Trichococcus)是黄色番茄品种植株茎部特有的优势的内生细菌属.此外,果实颜色为红色的番茄品种植株茎部中,拥有比黄色番茄品种更为丰富的内生细菌属与基因功能.[结论]果实颜色分别为红色和黄色的番茄品种植株茎部,形成了特异的内生细菌群落组成与功能,红色品种拥有比黄色品种更丰富的特有优势内生细菌属与基因功能,番茄果实颜色形成与植株内生细菌的群落组成与功能紧密相关.
番茄;内生细菌;高通量测序;功能预测
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国家自然科学基金;广西重点研发计划;广西科技重大专项
2022-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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