副溶血性弧菌脂蛋白定位系统转运蛋白结构与功能的生物信息学分析

摘要：

[目的]副溶血性弧菌是一种重要的人畜共患病原菌,脂蛋白定位系统(Localization of lipoprotein system,Lol)负责该菌脂蛋白的转运与定位,与其致病力及耐药性密切相关,对Lol系统转运蛋白进行系统的生物信息学分析,有助于推动副溶血性弧菌致病与耐药机理的进一步研究.[方法]本文通过生物信息学分析技术,结合ExPASy在线工具、SignalP 4.0 Server、TMHMM-2.0、STRING、SWISS-MODEL等软件,分析了副溶血性弧菌Lol系统转运蛋白LolA-E及LolCD2E的基本性质、蛋白互作关系及三级结构.[结果]LolA和LolB为酸性亲水蛋白,含信号肽位点,无跨膜区域.LolC和LolE为碱性疏水膜蛋白,LolCD2E为中性疏水膜蛋白,LolC-E及LolCD2E均无显著的信号肽位点.蛋白相互作用网络显示,LolA-E五个蛋白的编码基因均共表达,负责脂蛋白的合成与转运,并与BamA、Pal、MacB、CmeC等外膜蛋白具有密切的互作关系.三级结构同源建模发现,副溶血性弧菌与大肠杆菌拥有相似的LolA和LolB结构,LolC-E含有MacB蛋白的同源结构,赋予了该系统消耗ATP运输脂蛋白的重要功能.此外,本研究还首次发现了副溶血性弧菌LolC和LolE中存在一段保守的Hook结构,是LolCD2E复合物与LolA结合并转运脂蛋白的关键区域.[结论]本研究为副溶血性弧菌Lol系统转运蛋白的表达纯化、结构与功能的研究提供了重要的数据基础,为后续抗菌药物的研发提供了新型作用靶点.

关键词：副溶血性弧菌、脂蛋白定位系统、生物信息学分析、蛋白三级结构

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资助基金：国家自然科学基金;国家博士后创新人才支持计划;上海市"超级博士后"激励计划;上海市教育委员会科研创新计划;国家重点研发计划;上海市科技兴农项目;中国博士后科学基金

在线出版日期：2020-11-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2242-2252