一株从红藻中分离出的产芳基硫酸酯酶的海单胞菌FW-1的全基因组测序及结果分析
[目的]海单胞菌Marinomonas sp.FW-1是1株经验证可以获得高活性芳基硫酸酯酶的菌株.为深入研究FW-1菌株产芳基硫酸酯酶机制,进一步筛选高活性的芳基硫酸酯酶基因片段,有必要解析FW-1菌株的全基因组序列信息.[方法]本研究采用高通量测序技术对FW-1进行全基因组测序,使用相关软件对测序数据进行基因组装、基因预测与功能注释、COG聚类分析等.结合异源表达的方法对其不同基因片段所产生的芳基硫酸酯酶活性进行分析.[结果]全基因组测序结果表明该基因组大小为3964876 bp,GC含量为44.03％,编码3590个蛋白基因,含有78个tRNA和25个rRNA操纵子.从全基因组测序结果中找到22个可能具有芳基硫酸酯酶活性的基因,对其中4个进一步异源表达后发现FW-1中至少含有的3个具有芳基硫酸酯酶活性的基因,其均含有芳基硫酸酯酶的特异性氨基酸基团C-X-P-X-R基团.[结论]本研究首次报道了1株含有多个芳基硫酸酯酶基因序列的菌株FW-1的全基因组序列,分析了基因组的基本特征,为芳基硫酸酯酶的进一步应用提供了思路.
海单胞菌、全基因组测序、芳基硫酸酯酶
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山东省重点研发计划2016GSF121034;国家海洋局国家公益性行业科研专项201405040Supported by the Grant of Shandong Provincial Key Research and Development Project2016GSF121034;by the Grant of Public Science and Technology Research Funds Projects of Ocean201405040
2019-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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