成都平原不同种植方式折耳根表面附生细菌群落结构与抗生素抗性基因分析

摘要：

[目的]分析有机、化肥和野生折耳根表面的附生细菌群落结构和抗生素抗性基因(ARGs),揭示细菌群落结构与ARGs相互关系.[方法]高通量测定16S rRNA V3-V4可变区序列分析样品表面附生细菌群落结构;PCR和qPCR扩增29种ARGs基因分析样品表面ARGs污染情况;冗余分析(RDA)探讨细菌群落结构与ARGs的相互关系.[结果]折耳根表面检测到35个属的细菌,其中有机折耳根表面附生细菌多样性低于化肥和野生折耳根(P＜0.05);29种被检的ARGs中,有14种在折耳根中被检出,其中有机折耳根含有全部被检出的ARGs,化肥和野生折耳根则含有部分被检出的ARGs.折耳根表面ARGs污染的多样性和丰度显著受到样品表面的菌群结构影响,其中Lactococcus、Escherichia、Fluviicola、Enterococcus、Sanguibacter和Acidovorax是影响ARGs最主要的菌群.[结论]有机种植极大地改变了折耳根表面附生细菌的群落结构,增加了ARGs的多样性和丰度,对有机折耳根的食品安全带来了潜在威胁.因此,有必要将ARGs污染监测纳入到有机折耳根的食品安全考核范围内.

关键词：折耳根、高通量测序、原核微生物多样性、抗生素抗性基因、定量PCR

所属期刊栏目：59

资助基金：国家自然科学基金31571935;四川省应用基础重点2018JY0045;成都市一般项目2016-NY02-00064-NC;西华大学研究生创新基金YCJJ2017044

在线出版日期：2019-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：489-498