深海太平洋火色杆菌琼胶降解基因分析和琼胶酶Aga0950的表达及酶学性质
[目的]对深海太平洋火色杆菌(Flammeovirga pacifica WPAGA1)全基因组进行生物信息学分析,筛选获得琼胶酶基因aga0950,采用基因工程手段对该基因的功能和性质进行验证和分析.[方法]采用Illumina HiSeq2500测序技术进行基因组测序分析;采用克隆表达和镍柱纯化方法获得纯aga0950基因表达产物;采用薄层层析(TLC)和离子色谱(IC)法分析酶降解琼胶产物;采用二硝基水杨酸法(DNS)测定琼胶酶活性.[结果]基因组序列分析表明,菌株WPAGA1全基因组拥有13个β-琼胶酶相关基因;氨基酸序列比对显示,同源性为60％-85％,其中aga0950是具有GH16家族典型特征的基因,同源性为67％.纯化的重组酶Aga0950比活力达51770 U/mg,具有高效降解琼胶活性,降解终产物为新琼四糖和新琼六糖;最适温度为50℃,最适pH为4.0-10.0;Co2+、Mn2+和Fe3+促进酶活,Cu2+抑制酶活.[结论]深海菌株WPAGA1具有丰富的琼胶酶基因;属于GH16家族的琼胶酶基因aga0950表达产物具有高效降解胶琼活性和良好的热、酸、碱稳定性.
琼胶酶、琼胶寡糖、基因组、太平洋火色杆菌
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国家海洋公益性专项;福建省科技计划重点项目;国家海洋局第三海洋研究所基本科研业务项目;Supported by the National Marine Public Industry Research of China 201505026,by the Natural Science Foundation of Fujian Province 2017N0015 and by the Scientific Research Foundation of Third Institute of Oceanography,SOA 2016038
2021-07-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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