沙门氏菌CRISPR位点的结构特征比较
成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR),是存在于多数细菌和古菌中的遗传结构,能够有效防御外源DNA的入侵(质粒、噬菌体等),进而防御外源基因的水平转移.[目的]本研究以沙门氏菌属中常见的鸡伤寒沙门氏菌(Salmonella gallinarum)、鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)、猪霍乱沙门氏菌(Salmonella choleraesuis)以及肠炎沙门氏菌(salmonella enteritidis)等30个菌株为研究对象.探索CRISPR位点在不同沙门氏菌种中的结构差异.[方法]通过生物信息学的方法比较间隔序列与插入序列的同源性以及CRISPR位点与质粒数量关系.[结果]30株沙门氏菌中均存在CRISPR结构,包括CRISPR位点61个以及可疑位点12个.重复序列和cas1基因均不能作为这4类细菌的分类依据.[结论]虽然我们发现CRISPR位点数量与间隔区数量和质粒数量之间均不存在统计学关系,但间隔序列整合子、耐药基因等移动遗传原件具有一定的同源性,说明沙门氏菌在进化过程中不断受外源基因的侵袭.
沙门氏菌、CRISPR、间隔区、质粒
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the Zhejiang Science and Technology Plan Project2017C32036;by the Food Science and Engineering-the Most Important Discipline of Zhejiang Province 2017SICR118浙江省科技计划项目2017C32036;食品科学与工程浙江省重中之重一级学科2017SICR118
2018-04-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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