肺囊康定产生菌Glarea lozoyensis线粒体基因组序列的再分析
[目的]Glarea lozoyensis是抗真菌药物卡泊芬净的产生菌,其突变菌株ATCC 74030的线粒体基因组已被报道.我们此前的研究发现诱变剂能引起该菌某些细胞核基因的突变,但诱变剂是否也能引起线粒体DNA序列的改变并不清楚.[方法]组装野生型菌株ATCC 20868的线粒体基因组,并与发表的突变型菌株ATCC 74030的线粒体基因组进行比较.通过PCR验证野生和突变菌株线粒体基因组间表现差异之处,并利用正确的线粒体基因组序列进行新的分析.[结果]我们成功组装出野生型菌株ATCC20868的线粒体基因组,通过比较其与发表的ATCC 74030的线粒体基因组序列,发现存在6处单核苷酸变异位点和2处具有长度差异的区域.然而,随后的PCR验证和序列比较并没有发现2个菌株间存在这些差异.最初观察到的碱基差异是因为发表的ATCC 74030线粒体基因组存在序列错误.有趣的是,在Glarea lozoyensis的线粒体基因组中,我们发现存在3个具有内含子的tRNA基因和1个rnpB基因.同时,该菌线粒体基因组中存在多种重复序列,在其线粒体和细胞核基因组间也存在明显的DNA片段重复事件.[结论]诱变剂没有引起G.lozoyensis线粒体DNA的任何改变;发表的ATCC 74030的线粒体基因组存在序列错误.我们报道G.lozoyensis正确的线粒体基因组序列,并且发现该菌线粒体和细胞核基因组间频繁的基因交流.
基因转移、Glarea lozoyensis、内含子tRNA、线粒体基因组、诱变剂
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TU9;K29
国家自然科学基金81102759;山西省自然科学基金2014021030-2,201601D011065;山西省留学回国人员科技活动择优资助项目;山西省大型科学仪器设备专项;the National Natural Science Foundation of China81102759;by the Natural Science Foundation of Shanxi Province2014021030-2,201601D011065;by the Fund Program for the Scientific Activities of Selected Returned Overseas Professionals in Shanxi Province and by the Special Fund for Large Scientific Instruments and Equipments in Shanxi Province
2017-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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