23株不同地理来源嗜酸硫杆菌的系统发育及其遗传差异

摘要：

[目的]研究不同地理来源嗜酸硫杆菌的系统发育及其遗传差异,以及基因指纹图谱技术聚类与嗜酸硫杆菌地理来源的相关性.[方法]采用16S-23S rRNA间隔区(ITS)序列建立系统发育树,并结合ERIC和BOXAIR两种引物进行rep-PCR,以及rus基因扩增,对不同地理来源嗜酸硫杆菌进行分析.[结果]分离自不同样点的23株嗜酸硫杆菌遗传差异显著,依据ITS序列系统发育树被划分为5个大类群,与rep-PCR指纹图谱的分类结果较为接近,其中Acidithiobacillus ferrooxidans在ITS系统发育和BOXAIR-PCR指纹聚类分析中被划分为2个类群,但在ERIC-PCR中归为1个类群,rus基因分组中,在系统发育和聚类分析中处于同一类群的菌株拥有不同类型的rus基因,说明嗜酸硫杆菌的亚铁氧化途径与系统发育类群无明显相关性;ITS基因拥有区分近缘种或亚种的能力,且BOXAIR-PCR的分辨能力较强,非常适于嗜酸硫杆菌的遗传差异分析.

关键词：嗜酸硫杆菌、ITS序列、rep-PCR、rus基因、遗传差异

所属期刊栏目：57

分类号：D92;S82

资助基金：国家自然科学基金31260001,C010101Supported by the National Natural Science Foundation of China 31260001,C010101

在线出版日期：2017-05-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：560-570