聚苹果酸生产菌出芽短梗霉CCTCC M2012223的全基因组测序及序列分析
[目的]解析出芽短梗霉CCTCC M2012223的基因组序列信息,分析其代谢产物聚苹果酸、黑色素、普鲁兰多糖合成相关基因,为深入研究遗传多样性和代谢工程改造提供序列背景信息.[方法]使用Illumina HiSeq高通量测序平台对出芽短梗霉CCTCC M2012223菌株进行全基因组测序,并对测序数据进行序列拼接,基因预测与功能注释,COG/GO聚类分析,比较基因组学分析等.下载其他5株出芽短梗霉基因组序列,比较分析6株菌的种内同源基因、全基因组进化以及代谢产物合成相关基因.[结果]出芽短梗霉CCTCC M2012223基因组序列全长30756831 bp,GC含量47.49％,编码9452个基因.比较基因组分析表明出芽短梗霉CCTCC M2012223的基因组组装长度最长,6株菌的同源基因数达到7092个,普鲁兰多糖和聚苹果酸合成相关基因的蛋白序列有很高的保守性.出芽短梗霉CCTCCM2012223和Aureobasidium pullulans var.melanogenum亲缘关系最近,而这2株菌的黑色素合成相关基因的蛋白序列有一些插入和突变.[结论]本研究解析了出芽短梗霉CCTCCM2012223的基因组序列信息,获得黑色素、普鲁兰多糖和聚苹果酸合成相关基因,为后续的代谢机制解析和改造提供相关依据.
出芽短梗霉、全基因组测序、比较基因组分析、代谢机制、聚苹果酸
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国家自然科学基金31571816;国家“863计划”2015AA021005,2014AA021205;重庆市社会事业与民生保障专项cstc2016shmszx80075;重庆市知识产权专项基金CQIPO2015224Supported by the National Natural Science Foundation of China 31571816,by the National High Technology Research and Development Program of China 863 Program 2015AA021005,2014AA021205,by the Chongqing Social and People's Livelihood Guarantee Special Program cstc2016shmszx80075,and by the Chongqing Intellectual Property Special Foundation Program CQIPO2015224
2017-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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