雄烯二酮高产菌新金分枝杆菌MN4的全基因组测序及序列分析
[目的]新金分枝杆菌(Mycobacterium neoaurum)MN4是l株经诱变育种获得的高产雄烯二酮,并且能够耐受高浓度底物植物甾醇的突变菌株.为深入研究MN4菌株耐底物的机制及雄烯二酮的生物合成途径,有必要解析MN4菌株的全基因组序列信息.[方法]本研究采用高通量测序技术对MN4进行全基因组测序,然后使用相关软件对测序数据进行基因组装、基因预测与功能注释、COG聚类分析以及次级代谢产物合成基因簇预测等.[结果]新金分枝杆菌MN4基因组装获得33个Comigs,整个基因组大小为5.39 Mb,GC含量为66.9％,编码4920个蛋白基因,序列提交至GenBank数据库,登录号为JXYZ00000000.[结论]本研究首次报道了1株高产雄烯二酮菌株MN4的全基因组序列,分析了基因组的基本特征,初步解析了该菌株降解植物甾醇生产雄烯二酮的关键基因,将为MN4的功能基因组学研究及相关次级代谢产物的生物合成途径与异源表达研究提供基础.
雄烯二酮、新金分枝杆菌、甾醇、全基因组测序、生物合成基因簇
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江西省科技厅支撑计划项目20142BBG70016;江西省自然科学基金20142BAB214008,20151BAB204003;江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室开放基金YRD201405;Supported by the Science and Technology Support Program of Jiangxi Province 20142BBG70016,by the Natural Science Foundation of Jiangxi Province 20142BAB214008,20151BAB204003 and by the Development Foundation of Key Laboratory of Protection and Utilization of Subtropic Plant Resources YRD201405
2016-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1358-1367
