基于高通量测序分析盐角草根部内生细菌多样性及动态规律
[目的]探讨盐角草根部内生细菌群落多样性特征,揭示内生细菌群落结构在宿主关键发育期动态变化规律.[方法]通过罗氏454高通量测序获得内生细菌16S rRNA片段,然后进行生物信息分析.[结果]共获得20363条16S rRNA基因序列.各样品中可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)在552-941之间.根部内生细菌群落主要包括4个门,其中Proteobacteri门占主导地位,其余依次是Firmicutes,Actinobacteria,Bacteroidetes.在Proteobacteria门中,Gammaproteobacteria是第一大纲,其后是Betaproteobacteria纲.宿主5个发育时期共同拥有7个细菌属,包括Azomonas,Serratia,Pantoea,Serpens,Pseudomonas,Halomonas,Kushneria.整体上看,Gammaproteobacteria纲在宿主5个发育时期呈现增长趋势.优势菌属在5个发育期存在差异,分别为Delftia,Kushneria,Serratia,Pantoea,Erwinia.所有文库总共含2108个特异OTUs,共同拥有5个相同OTUs.花期OTUs数量最多,结种期内生细菌多样性降低.在宿主的5个发育时期中,土壤pH、月均温和土壤盐含量这3个环境因子组成的集合对其内生细菌群落变化具有显著影响.[结论]盐角草内生细菌群落多样性丰富,宿主发育期决定了内生细菌群落结构.
盐生植物、内生细菌、多样性、焦磷酸测序
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2016-06-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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