嗜热链球菌CRISPR-Cas系统的检测
[目的]CRISPR-Cas系统为嗜热链球菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,分析NCBI中已公开发表全基因组序列的9株嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统的数目和类型,对实验室相应菌株的CRISPR-Cas系统进行检测.[方法]利用生物信息学方法对NCBI中9株已测序嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统进行分析,根据其Cas基因序列设计引物,对实验室嗜热链球菌菌株的Cas基因进行扩增、测序,分析实验室6株嗜热链球菌的CRISPR-Cas系统情况.[结果]9株标准菌株均含不同数目的CRISPR-Cas系统,其类型主要为Ⅱ-A型、Ⅲ-A型和Ⅰ-E型,各类型的标志Cas基因高度保守.6株供试菌中,S4仅含Cas9基因,其它5株均含有Cas9基因、Ca1O基因和Cas9*基因,79和KLDS3.0207还含有Cas3基因.[结论]可根据标准菌株高度保守的Cas基因设计引物,预测未知嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统的数目和类型.S4仅含1个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统,其它5株均含有2个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统和1个Ⅲ-A型CRISPR-Cas系统,此外,79和KLDS3.0207均含有1个Ⅰ-E型CRISPR-Cas系统.
嗜热链球菌、规律成簇的间隔回文重复(CRISPR)、CRISPR-Cas系统、Cas、生物信息学分析
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国家自然科学基金31171717;国家“863计划”2012AA022108Supported by the National Natural Science Foundation of China 31171717 and by the National Programs for High Technology Research and Development of China 2012AA022108
2016-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
680-688
