近20年中国部分地区鸡源H9N2亚型禽流感病毒HA基因遗传演化及其变异频率
[目的]通过比较不同时期的H9N2亚型禽流感流行毒株HA基因的分子特征和变异频率,揭示免疫压力下病毒的遗传演化趋势.[方法]选取源于课题组的40株鸡源H9N2毒株,以及从GenBank下载的136株中国鸡源H9N2流行毒株和7株经典毒株的序列,利用Lasergen 7.1和MEGA 5.1等软件,对其HA基因进行系统演化、分子特征和变异频率分析.[结果]系统发育分析表明,近20年的鸡源H9N2流行株分属于BJ94、Y280和S2等谱系,优势流行株的分布与年代密切相关.氨基酸序列比较显示,H9N2病毒不同谱系之间具有各自的特征,且存在着明显的氨基酸变异积累.以Ck/BJ/1/1994 HA基因为参照,1994-2014年间,H9N2流行株核苷酸和氨基酸的年均进化率分别为5.73×10-3和4.25×10-3.其中,2011-2014年的核苷酸(氨基酸)年均进化率为6.35×10-3(5.32× 10-3),明显高于2006-2010年5.22×10-3(3.70×10-3),更显著高于疫苗推广初期1999-2005年的0.74×10 3(0.50×10-3).[结论]H9N2疫苗株和流行毒株的不匹配是病毒变异频率加快的重要原因.
H9N2、禽流感、HA基因、进化、变异频率
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2016-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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