肌苷生产菌枯草芽孢杆菌ATCC 13952的全基因组测序及序列分析
[目的]枯草芽孢杆菌ATCC 13952是一株肌苷工业生产菌株.为深入研究ATCC 13952菌株积累肌苷的分子机制以及为进一步分子育种研究提供序列背景信息,有必要解析ATCC 13952菌株的基因组序列信息.[方法]本研究采用高通量测序和Sanger测序相结合对ATCC 13952菌株进行全基因组测序,然后使用相关软件对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、GO/COG聚类分析、共线性分析等.[结果]枯草芽孢杆菌ATCC 13952整个基因组大小为3876276 bp,GC含量为45.8%,序列已提交至GenBank数据库,登录号为CP009748.比较基因组及嘌呤代谢相关基因分析结果显示:枯草芽孢杆菌ATCC 13952与其他几株芽孢杆菌具有较好的基因组共线性关系,嘌呤代谢相关基因编码的蛋白与标准菌株比较发生了一些缺失和突变.[结论]本研究首次报道了一株肌苷生产菌枯草芽孢杆菌ATCC 13952的全基因组序列,分析了基因组基本特征,初步探讨了该菌株积累肌苷的分子机制,为后续的进一步分子育种提供了理论基础.
肌苷、枯草芽孢杆菌、全基因组测序、分子机制、比较基因组分析
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Q933(微生物学)
国家自然科学基金31260137;江西省自然科学基金20132BAB214006Supported by National Natural Science Foundation of China 31260137 and Natural Science Foundation of Jiangxi Province 20132BAB214006
2016-01-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
1560-1567