[目的]了解肇庆星湖湿地放线菌多样性及其与底泥理化性质的关系.[方法]应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-density gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术对星湖湿地10个样点放线菌群落进行研究,根据DGGE图谱及克隆测序结果对其物种多样性进行分析,并结合样点理化性质对其空间分布特征进行分析.[结果]通过PCR-DGGE指纹图谱发现各样品放线菌物种丰富度(S)、多样性指数(H')和均匀度指数(J')均有所不同.对不同样点放线菌群落相似性进行比较,发现它们的相似性系数存在着一定的关系,相邻样点间相似性较高.对DGGE优势条带进行回收、克隆、测序,显示优势类群主要分布于类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)、链霉菌科(Streptomycetaceae)、小单孢菌科(Micromonosporaceae)、微球菌科(Micrococaceae)、纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)和原小单胞菌科(Promicromonosporaceae).典型对应分析结果表明,星湖湿地放线菌群落结构变化的主要影响因子为底泥水溶性碳(WSOC)和速效磷(A-P).[结论]肇庆星湖湿地蕴含着大量的放线菌资源,具有较高的物种多样性,需要进一步挖掘这些新资源.
聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳、放线菌群落、典型对应分析
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Q933(微生物学)
Supported by the National Natural Science Foundation of China 31300011,by the Guangdong Provincial Research Foundation for Basic Research 2013B060400043,by the Special Foundation for Young Scientists of Guangdong Academy of Sciences rcjj201301 and by the Foundation for Young Scientists of Guangdong Institute of Microbiology;国家自然科学基金项目31300011;广东省科技基础条件建设项目2013B060400043;广东省科学院优秀青年科技人才基金项目rcjj201301;广东省微生物研究所南粤微生物优秀人才培育基金项目