柠檬明串珠菌及相近种部分持家基因的系统发育分析
[目的]利用16S rRNA、dnaA、murC和pyrG基因分子标记研究Leuconostoc citreum(Leu.citreum)及相近种间的种系发育关系,并比较这些基因序列对Leu.citreum及相近种的区分能力.[方法]以分离自酸面团中的7株Leu.citreum为研究对象,以dnaA、murC和pyrG基因片段为标记,通过PCR扩增、测序,结合已公布的近缘种及亚种相应序列,计算遗传距离,构建系统发育树,并与16S rRNA基因进行比较.[结果]研究发现Leu.citreum及相近种间的dnaA、murC和pyrG基因构建的系统发育树拓扑结构与16S rRNA基因基本一致,区别在于相似性的不同,其分别为75.5%-97.2%、50.2%-99.7%、65.0%-99.8%和98.5%-100%.[结论]在Leu.citreum及相近种间的种系发育关系中,dnaA、murC和pyrG基因与16S rRNA基因系统进化关系都具有很好的一致性,但这三个持家基因的遗传距离显著高于16S rRNA基因.因此,采用dnaA、murC和pyrG基因可以用于Leu.citreum及相近种的分类鉴定.
柠檬明串珠菌、系统发育分析、16S rRNA基因、持家基因
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内蒙古自治区科技应用项目20120242;农业部现代农业产业技术体系建设项目CARS-37;内蒙古自然科学基金开放课题20102010;the Science Application Project of Inner Mongolia20120242;by the Modern Agricultural Technology Projects of the Ministry of AgricultureCARS-37;by the National Natural Science Foundation of Inner Mongolia20102010
2013-08-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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