一株深海热液环境来源的PAHs降解菌TVG9-Ⅶ的系统发育与降解基因

摘要：

[目的]对一株深海热液环境来源的多环芳烃( PAHs)降解菌进行系统发育分析并对其降解特性和降解机制进行研究.[方法]对16S rRNA基因进行扩增和测序,进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析；利用GC-MS测定其对PAHs的降解率；通过构建基因组Fosmid文库,克隆PAHs降解基因簇；并利用RT-PCR和qPCR研究关键降解酶基因在不同PAHs诱导下的表达情况.[结果]从西南太平洋劳盆地热液沉积物中分离到一株PAHs降解菌株TVG9-Ⅶ,系统发育分析结果表明,该菌株属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium),与该属的Novosphingobium indicum H25T系统发育关系最为密切,它们的16S rRNA基因序列相似性高达99.7％.该菌株在21 d内对菲、荧蒽和芘的降解率分别为95.2％,57.3％和69.6％.从Fosmid文库中筛选得到一个负责PAHs降解的上游基因簇,包含了PAHs起始降解双加氧酶大小亚基(pheA1a/b)基因和一个脱氢酶基因；RT-PCR和qPCR实验表明,双加氧酶大亚基基因pheA1a在菲的诱导下上调表达4.2倍,而在萘及高环荧蒽和芘的诱导下无上调.[结论]菌株TVG9-Ⅶ是Novosphingobium属深海热液来源的PAHs降解菌,具有良好的降解特性,特别是对高环PAHs的降解效果较好.

关键词：深海热液区、新鞘氨醇杆菌、多环芳烃、降解基因簇、双加氧酶

所属期刊栏目：51

分类号：X172(环境生物学)

在线出版日期：2012-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1548-1554